InstanSeg : comparaison CPU, GPU et MPS
InstanSeg : comparaison CPU, GPU et MPS
Objectif
À la fin, vous aurez reproduit cette étape de bout en bout sur un cas test.
Avant de commencer
- QuPath 0.7 installé.
- Au 3 mars 2026, la version officielle vérifiée est
v0.7.0-rc1. - Extension InstanSeg ou StarDist installée selon l’article.
- Une ROI test pour valider rapidement le résultat.
Pas à pas
- Tester d’abord le pipeline en CPU (robustesse).
- Activer GPU NVIDIA si disponible pour la production.
- Sur Apple Silicon, utiliser MPS si l’extension le supporte.
- Comparer le temps sur la même image et mêmes paramètres.
- Conserver le mode le plus stable, pas seulement le plus rapide.
À copier-coller
# Linux/Windows (NVIDIA)
nvidia-smi
nvcc --version
# macOS Apple Silicon
system_profiler SPHardwareDataType | grep 'Chip'
Vérifier que ça marche
- Des objets sont bien détectés dans la ROI test.
- Pas de sur-segmentation massive en bordure.
- Les mesures exportées sont non vides.
En cas de problème
- Tester d’abord en CPU puis passer en GPU/MPS.
- Réduire la taille de tuile si erreur mémoire.