Warpy : installation et test rapide
Warpy : installation et test rapide
Objectif
À la fin, vous aurez reproduit cette étape de bout en bout sur un cas test.
Avant de commencer
- Deux lames du même tissu (référence + cible).
- Outil d’alignement installé (Warpy ou VALIS).
- Un dossier de sortie dédié pour les transformations.
Pas à pas
- Installer l’extension Warpy depuis son dépôt officiel.
- Vérifier la compatibilité avec la version QuPath.
- Redémarrer QuPath puis vérifier la présence du menu Warpy.
- Tester un alignement sur 2 lames pilotes.
- Conserver la version Warpy utilisée dans les notes projet.
À copier-coller
Validation minimale:
- Menu Warpy présent
- Exécution sans erreur sur un test 2 lames
- Fichier de transformation généré
Vérifier que ça marche
- Les repères anatomiques se superposent correctement.
- Le décalage global est faible sur 3 zones de contrôle.
- Les sorties d’alignement sont bien générées.
En cas de problème
- Vérifier que les lames ont des résolutions compatibles.
- Refaire le test sur une zone anatomique simple.